São funções da Veterinária Militar tanto no tempo de paz como nos de guerra:
- Prevenir, diagnosticar e tratar das zoonoses, que são as doenças dos animais que podem contaminar a tropa.
- Prevenção da infecção hospitalar.
- Combate aos animais peçonhentos e aos insetos.
- Garantir a qualidade dos alimentos e da água servidos à tropa.
- Ocupar-se dos assuntos relativos à guerra biológica e nuclear.
- Produção de soros hiperimunes para o controle das picadas de animais peçonhentos, como cobras aranhas e escorpiões.
- Controlar a limpeza e a higienização das instalações militares.